近年来，巩留县大力实施“生态立县、科教兴县、工业强县、旅游名县、文化塑县”战略，不断加大科技投入力度， 2013年科技支出达到2075万元，同比增加239万元，增长13%，高于经常性收入增幅，科技投入超过法定增长及规定的标准。

　　拓宽渠道，不断完善配套的科技培训体系。通过实施“素质工程”、开展“科技之冬”、“科技之夏”、举办“科技活动周”等科技宣传培训活动，开办各类实用技术培训班977期，完成农牧民培训7.8万人（次），全县农村劳动力培训率达85%以上，青壮年劳动力的系统培训率达10%以上，全县乡村领导干部科技培训率达95%以上，建立科普示范基地7个，该县于2011年被中国科协命名为“全国科普示范县”。

　　加强企业科技进步工作。2011年投资3050万元进一步完善了“一园三区”建设，建成工业产业区面积达11.4平方公里，入园企业29家，规模以上企业11家，企业内部均建立配套的技术研发机构；2012年实施了伊禧堂、利世得、登海种业改扩建项目，加快推进水泥技改项目和煤电项目的前期工作，完善了工业园区规划及配套设施建设，民营科技企业建设力度加大，2012年有新疆利世得生物科技有限公司、新疆伊犁佳和乳业有限公司和巩留伊禧堂生物科技有限公司等三家企业通过伊犁州民营科技企业评审认定和授牌。

　　加快建设农业科技示范园。2013年共安排科技三项经费925.21万元。投入新建养殖小区4座共计100万元，改造提升养殖小区养殖小区2座50万元,特色种植181.5万元。