2008年自治区人民政府设立每年2000万元科技支（援）疆专项资金。从2009年开始，自治区科技支疆计划实行引导性、指令性、以奖代补三种计划支持方式。与此同时，带动内地、区内有关单位在新疆进行科技投入。目前，科技援疆专项计划已下达项目529个，累计下拨经费1亿元，项目投资总额达50.33亿元，涉及工业、农业、社会发展、软科学等多个领域。在科技援疆专项资金的引导下，全国各大院校、科研院所、大中型企业、高新技术园区纷纷来疆开展合作，吸引和集聚了一大批国内优秀科技人才，有效推动了新疆的科技发展和人才队伍建设，为新疆跨越式发展提供了有力支撑。

　　当前，科技援疆工作已进入新的发展阶段，面临前所未有的机遇和挑战，科技合作需求日益旺盛，合作领域不断拓展。《全国科技援疆规划》发布以来，19省市拟支持82个县市建设综合科技服务中心；科技部从各地州征集科技援疆项目450余项向全国发布；今年第四次全国科技援疆会议签订重大合作项目79项，涉及金额13.62亿元；国内一些高校、科研院所与我区签订战略合作协议等等新一批科技援疆合作项目即将实施。同时，更多的项目需要支持，急需自治区科技援疆资金引导使之形成“倍增效应”，推动科技援疆工作深入开展。