为提高工作效率，降低管理成本，在实现资金封闭安全运行的基础上，三河市财政局于2008年5月正式启用新型农村合作医疗网上银行业务，利用农业银行的“金E顺”网上银行平台，划转新型农村合作医疗补偿资金。相对于传统的手工转账业务，网上银行发放补偿费具有资金到位快、工作效率高等优点。截至目前，已通过网上银行发放“新农合”补偿金1083万元。三河市主要采取以下三项措施，保障“新农合”网上银行运行的资金安全。 

　　一是建立健全相互监督制约机制。“新农合”网上银行业务设财政管理员一名，新农合管理机构和财政操作员各一名，财政管理员设置操作员的权限，对其工作进行监督，但无业务操作权限；新农合管理机构操作员审核录入人员及定点医疗机构信息，但无资金支付权限；财政操作员根据信息核拨资金，但无信息录入修改权限。 

　　二是部门配合，账户零余额管理。财政在银行新设“零余额”账户，平时账户余额为零，财政收到新农合管理机构上传的信息并经审核无误后，将补偿资金从财政基金专户划转到“零余额”账户，到账后随即拨付，若出现录入信息错误无法拨付等情况，财政立即将退回的资金划转回财政基金专户，确保网上银行专户“零余额”。 

　　三是完善社会化发放程序。按照“政府确定标准、管理部门提供信息数据，财政筹措拨付资金、金融机构具体发放”的原则，修改完善了社会化发放程序，明确各方职责，加强资金监管，确保资金快捷、安全运行。