2012年6月21日，国务院批准撤销海南省西沙群岛、南沙群岛、中沙群岛办事处，设立地级三沙市，管辖西沙群岛、中沙群岛、南沙群岛的岛礁及其海域。同年7月24日正式挂牌成立，三沙市人民政府驻西沙永兴岛。

　　三沙市人民政府自成立以来，政府机构已经建立，管理体制机制逐步完善，经济社会建设正全面铺开。根据《预算法》和《国家金库条例》中“一级政府、一级财政、一级国库”的有关要求，为履行财政预算职能，确保财政资金准确、及时调度，加快三沙市经济社会建设和发展,中国人民银行海口中心支行于2013年5月6日决定成立中华人民共和国国家金库三沙市中心支库。三沙市中心支库的成立，有利于三沙财政资金、非税收入等各类资金的监管，更为突出国家主权和海洋权益的存在。